MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Corynebacterium pseudotuberculosis 3/99-5 chromosome

Total Repeats: 44193

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_016781	AAG	2	6	38	43	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2	NC_016781	GCT	2	6	54	59	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_016781	CAA	2	6	399	404	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	375287587
4	NC_016781	AT	3	6	411	416	50 %	50 %	0 %	0 %	375287587
5	NC_016781	CTT	2	6	457	462	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	375287587
6	NC_016781	TCA	2	6	512	517	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	375287587
7	NC_016781	CA	3	6	609	614	50 %	0 %	0 %	50 %	375287587
8	NC_016781	TGC	2	6	626	631	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	375287587
9	NC_016781	G	6	6	660	665	0 %	0 %	100 %	0 %	375287587
10	NC_016781	TTCC	2	8	709	716	0 %	50 %	0 %	50 %	375287587
11	NC_016781	CGC	2	6	721	726	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	375287587
12	NC_016781	AGC	2	6	736	741	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	375287587
13	NC_016781	CAG	2	6	832	837	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	375287587
14	NC_016781	AGCC	2	8	856	863	25 %	0 %	25 %	50 %	375287587
15	NC_016781	ATGC	2	8	921	928	25 %	25 %	25 %	25 %	375287587
16	NC_016781	AT	3	6	1004	1009	50 %	50 %	0 %	0 %	375287587
17	NC_016781	CAGG	2	8	1028	1035	25 %	0 %	50 %	25 %	375287587
18	NC_016781	GAT	2	6	1080	1085	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	375287587
19	NC_016781	TCC	2	6	1093	1098	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	375287587
20	NC_016781	AAG	2	6	1105	1110	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	375287587
21	NC_016781	GAA	2	6	1119	1124	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	375287587
22	NC_016781	T	6	6	1125	1130	0 %	100 %	0 %	0 %	375287587
23	NC_016781	TACG	2	8	1222	1229	25 %	25 %	25 %	25 %	375287587
24	NC_016781	TGA	2	6	1294	1299	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	375287587
25	NC_016781	GGC	2	6	1304	1309	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	375287587
26	NC_016781	TTG	2	6	1321	1326	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	375287587
27	NC_016781	ATG	2	6	1488	1493	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	375287587
28	NC_016781	GATG	2	8	1559	1566	25 %	25 %	50 %	0 %	375287587
29	NC_016781	CG	3	6	1610	1615	0 %	0 %	50 %	50 %	375287587
30	NC_016781	ACCAC	2	10	1693	1702	40 %	0 %	0 %	60 %	375287587
31	NC_016781	GAA	2	6	1745	1750	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	375287587
32	NC_016781	ATG	2	6	1759	1764	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	375287587
33	NC_016781	GCA	2	6	1781	1786	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	375287587
34	NC_016781	TTC	2	6	1796	1801	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	375287587
35	NC_016781	TAAA	2	8	1828	1835	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_016781	AGT	2	6	1904	1909	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
37	NC_016781	TTA	2	6	2194	2199	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_016781	AAC	2	6	2249	2254	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
39	NC_016781	TGC	2	6	2308	2313	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_016781	GAG	2	6	2378	2383	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
41	NC_016781	GAAG	2	8	2427	2434	50 %	0 %	50 %	0 %	375287588
42	NC_016781	CCCA	2	8	2482	2489	25 %	0 %	0 %	75 %	375287588
43	NC_016781	TAC	2	6	2495	2500	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	375287588
44	NC_016781	TCA	2	6	2510	2515	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	375287588
45	NC_016781	GAT	2	6	2521	2526	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	375287588
46	NC_016781	GCT	2	6	2625	2630	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	375287588
47	NC_016781	CAT	2	6	2637	2642	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	375287588
48	NC_016781	CTGC	2	8	2767	2774	0 %	25 %	25 %	50 %	375287588
49	NC_016781	GCA	3	9	2827	2835	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	375287588
50	NC_016781	TC	3	6	3003	3008	0 %	50 %	0 %	50 %	375287588
51	NC_016781	GCT	2	6	3168	3173	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	375287588
52	NC_016781	GAAA	2	8	3253	3260	75 %	0 %	25 %	0 %	375287588
53	NC_016781	CGG	2	6	3305	3310	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	375287588
54	NC_016781	AGA	2	6	3333	3338	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	375287588
55	NC_016781	TTAC	2	8	3396	3403	25 %	50 %	0 %	25 %	375287588
56	NC_016781	GAG	2	6	3490	3495	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	375287588
57	NC_016781	CTG	2	6	3592	3597	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
58	NC_016781	TCGT	2	8	3681	3688	0 %	50 %	25 %	25 %	375287589
59	NC_016781	TTG	2	6	3764	3769	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	375287589
60	NC_016781	AT	3	6	3780	3785	50 %	50 %	0 %	0 %	375287589
61	NC_016781	CTG	2	6	3866	3871	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	375287589
62	NC_016781	TTG	2	6	4064	4069	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	375287589
63	NC_016781	GAT	2	6	4183	4188	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	375287589
64	NC_016781	GAG	2	6	4387	4392	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	375287589
65	NC_016781	CGT	2	6	4394	4399	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	375287589
66	NC_016781	A	6	6	4461	4466	100 %	0 %	0 %	0 %	375287589
67	NC_016781	GAC	2	6	4507	4512	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	375287589
68	NC_016781	CGA	2	6	4647	4652	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	375287589
69	NC_016781	AAGG	2	8	4837	4844	50 %	0 %	50 %	0 %	375287589
70	NC_016781	CTG	2	6	4866	4871	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	375287590
71	NC_016781	AGA	2	6	4882	4887	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	375287590
72	NC_016781	TGC	2	6	4906	4911	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	375287590
73	NC_016781	GCG	2	6	4930	4935	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	375287590
74	NC_016781	TC	3	6	4954	4959	0 %	50 %	0 %	50 %	375287590
75	NC_016781	A	6	6	5022	5027	100 %	0 %	0 %	0 %	375287590
76	NC_016781	ACG	2	6	5073	5078	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	375287590
77	NC_016781	CGG	2	6	5143	5148	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	375287590
78	NC_016781	TGG	2	6	5175	5180	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	375287590
79	NC_016781	A	6	6	5184	5189	100 %	0 %	0 %	0 %	375287590
80	NC_016781	AGC	2	6	5191	5196	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	375287590
81	NC_016781	AC	3	6	5197	5202	50 %	0 %	0 %	50 %	375287590
82	NC_016781	ATG	2	6	5276	5281	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	375287590
83	NC_016781	ATAC	2	8	5412	5419	50 %	25 %	0 %	25 %	375287590
84	NC_016781	TAA	2	6	5542	5547	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_016781	CACGC	2	10	5733	5742	20 %	0 %	20 %	60 %	375287591
86	NC_016781	CGG	2	6	5768	5773	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	375287591
87	NC_016781	ATGC	2	8	5814	5821	25 %	25 %	25 %	25 %	375287591
88	NC_016781	TGG	2	6	5867	5872	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	375287591
89	NC_016781	GGT	2	6	5904	5909	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	375287591
90	NC_016781	ACC	2	6	6057	6062	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	375287591
91	NC_016781	ACC	3	9	6096	6104	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	375287591
92	NC_016781	CAT	2	6	6116	6121	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	375287591
93	NC_016781	TCG	2	6	6125	6130	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	375287591
94	NC_016781	GAA	2	6	6198	6203	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	375287591
95	NC_016781	TGA	2	6	6224	6229	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	375287591
96	NC_016781	A	6	6	6259	6264	100 %	0 %	0 %	0 %	375287591
97	NC_016781	CCGATG	2	12	6271	6282	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	375287591
98	NC_016781	CTG	2	6	6298	6303	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	375287591
99	NC_016781	GAA	2	6	6308	6313	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	375287591
100	NC_016781	GAA	2	6	6320	6325	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	375287591
101	NC_016781	TTA	2	6	6335	6340	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	375287591
102	NC_016781	TGA	2	6	6428	6433	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	375287591
103	NC_016781	GAA	2	6	6531	6536	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	375287591
104	NC_016781	TGA	2	6	6562	6567	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	375287591
105	NC_016781	CG	3	6	6575	6580	0 %	0 %	50 %	50 %	375287591
106	NC_016781	AAAGAA	2	12	6597	6608	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	375287591
107	NC_016781	TCT	2	6	6816	6821	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	375287591
108	NC_016781	GGC	2	6	6836	6841	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	375287591
109	NC_016781	TGG	2	6	6887	6892	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	375287591
110	NC_016781	GGT	2	6	6972	6977	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	375287591
111	NC_016781	ATT	2	6	7095	7100	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	375287591
112	NC_016781	ATG	2	6	7123	7128	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	375287591
113	NC_016781	CAA	2	6	7139	7144	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	375287591
114	NC_016781	GCT	3	9	7208	7216	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	375287591
115	NC_016781	TTG	2	6	7221	7226	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	375287591
116	NC_016781	CCG	2	6	7278	7283	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	375287591
117	NC_016781	GAA	2	6	7356	7361	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	375287591
118	NC_016781	CAA	2	6	7385	7390	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	375287591
119	NC_016781	GAT	2	6	7392	7397	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	375287591
120	NC_016781	ATG	2	6	7498	7503	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	375287591
121	NC_016781	TGA	2	6	7514	7519	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	375287591
122	NC_016781	TCG	2	6	7556	7561	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	375287591
123	NC_016781	A	6	6	7622	7627	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_016781	TAG	3	9	7671	7679	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
125	NC_016781	T	6	6	7802	7807	0 %	100 %	0 %	0 %	375287592
126	NC_016781	TTC	2	6	7896	7901	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	375287592
127	NC_016781	GAG	2	6	7944	7949	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	375287592
128	NC_016781	AGC	2	6	7956	7961	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	375287592
129	NC_016781	TGC	2	6	7992	7997	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	375287592
130	NC_016781	GAG	2	6	8103	8108	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
131	NC_016781	AT	3	6	8125	8130	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_016781	ATG	2	6	8148	8153	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
133	NC_016781	TA	4	8	8187	8194	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_016781	GTT	2	6	8206	8211	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
135	NC_016781	CAA	2	6	8236	8241	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
136	NC_016781	TCGC	2	8	8248	8255	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
137	NC_016781	TTC	2	6	8263	8268	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
138	NC_016781	T	6	6	8285	8290	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_016781	ATT	2	6	8301	8306	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_016781	TTA	2	6	8408	8413	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_016781	GAAA	2	8	8468	8475	75 %	0 %	25 %	0 %	375287593
142	NC_016781	CTG	2	6	8545	8550	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	375287593
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145	NC_016781	CTG	2	6	8598	8603	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	375287593
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151	NC_016781	CGA	2	6	9085	9090	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	375287595
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160	NC_016781	TGA	2	6	9597	9602	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	375287595
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241	NC_016781	GT	3	6	13327	13332	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
242	NC_016781	GGT	2	6	13359	13364	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
243	NC_016781	T	6	6	13376	13381	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
244	NC_016781	GAC	2	6	13460	13465	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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256	NC_016781	TGA	2	6	13852	13857	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	375287598
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259	NC_016781	AGT	2	6	13993	13998	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	375287598
260	NC_016781	TTATC	2	10	14084	14093	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
261	NC_016781	TGT	2	6	14156	14161	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
262	NC_016781	ACGTA	2	10	14247	14256	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
263	NC_016781	AGG	2	6	14326	14331	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
264	NC_016781	GAA	2	6	14365	14370	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	375287599
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